CRIPSRi notað til að skoða erfðamengi baktería

Hvaða gen eru það sem bakteríur nýta sér til að verjast sýklalyfjum?

dna.jpg
Auglýsing

Þeir sem láta sig vís­indi varða hafa varla orðið var­huga af CRISPR/Cas erfða­breyt­inga­tækn­inni sem und­an­farið hefur verið „sætasta stelpan á ball­inu“ í hópnum aðferðir í sam­einda­líf­fræði.

CRISPR er upp­runnið í bakt­er­íum en með sam­ein­ingu hár­ná­kvæmr­ar þátta­pör­unn­ar og núk­le­asa­virkn­i ­kerf­is­ins ásamt DNA við­gerð­ar­ferlum spen­dýra­frumna varð til erfða­breyt­inga­tól sem er mun nákvæmara og skil­virkara en þau sem við höfum áður not­að.

Aðferðin hefur notið ákveð­innar sér­stöðu. Má þá t.d. telja að mat­væla­eft­ir­lit Banda­ríkj­anna til­kynnti á síð­asta ári að erfða­breyt­ingar sem unnar eru á mat­væl­um, þar sem CIR­SPR að­ferðin er not­uð, lúta ekki jafn ströngum reglu­gerðum og önnur erfða­breytt mat­væli.

Auglýsing

Þró­un ­með­ CRISPR að­ferð­ina hafa nú leitt hana aftur til­ ­upp­runans, í bakt­er­í­urn­ar. CRISPRi, sem stendur fyrir „clu­ster­ed reg­ulated inter­spaced pa­lindromic repeats inter­fer­ence“, er tól þar sem CRISPR er nýtt til að hindra tján­ingu á ákveðnum gen­um.

Vegna þess hve nákvæm þátta­pör­un CRISPR flókans er við mark-erfða­efn­ið, þóttu vís­inda­mönnum í Kali­forníu við hæfi að nýta aðferð­ina til að hindra tján­ingu gena. Hindr­unin fer ein­fald­lega þannig fram að CRISPR flók­inn situr á erfða­efn­inu svo pró­tínin sem sjá um tján­ingu gen­anna (um­rit­un­ar­þætt­irn­ir) kom­ast ekki að.

Þessi nýja aðferð hentar t.d. mjög vel þegar ein­tökin tvö af gen­inu sem eru til staðar í tví­litna frumu (eitt frá móður og eitt frá föð­ur) eru mis­mun­andi. Þá er hægt að nýta CRISPRi til að þagga tján­ing­una á öðru gen­inu og sjá hvaða áhrif það hef­ur.

Rann­sókn­ar­hópur við Uni­versity of Wiscons­in-Ma­d­i­son nýtti aðferð­ina nýlega til að skoða hvaða gen það eru sem bakt­er­íur nýta sér til að verj­ast sýkla­lyfj­um. Hóp­ur­inn byggði sér gena­safn sem hann gat svo prófað á fjöl­mörgum bakt­er­íu­stofn­um, bæði bakt­er­íum sem valda sýk­ingum og þeim sem gera það ekki.

Hóp­ur­inn gerir sér vonir um að geta nýtt þá þekk­ingu sem skap­ast í slíkum til­raunum til að þróa betri sýkla­lyf þegar við skiljum betur hvaða þætti bakt­er­í­urnar nýta sér þegar með­höndlun með sýkla­lyfjum á sér stað.

Fréttin birt­ist fyrst á Hvat­inn.is

Ert þú í Kjarnasamfélaginu?

Kjarninn er opinn vefur en líflínan okkar eru frjáls framlög frá lesendum, Kjarnasamfélagið. Sú stoð undir reksturinn er okkur afar mikilvæg.

Með því að skrá þig í Kjarnasamfélagið gerir þú okkur kleift að halda áfram að vinna í þágu almennings og birta vandaðar fréttaskýringar, djúpar greiningar á efnahagsmálum og annað fréttatengt gæðaefni. 

Kjarninn hefur verið til taks fyrir kröfuharða lesendur undanfarin sjö ár og við ætlum okkur að standa vaktina áfram. 

Fyrir þá sem nú þegar eru stoltir styrkjendur Kjarnans þá leyfum við okkur að benda á að hægt er að óska eftir að hækka mánaðarlega framlagið með því að senda póst á takk@kjarninn.is


Já takk, ég vil styrkja Kjarnann!
Leikhópurinn Lotta: Bakkabræður
Bakkabræður teknir í samfélagssátt
Leiklistargagnrýnandi Kjarnans fjallar um Bakkabræður í uppsetningu Leikhópsins Lottu.
Kjarninn 6. júní 2020
Heil vika án nýrra smita
Nýgreind smit síðasta sólarhringinn: Núll. Greind smit síðustu sjö sólarhringa: Núll. Í dag eru tímamót í baráttu Íslendinga gegn COVID-19. Í baráttunni gegn litla gaddaboltanum, veirunni sem virðist ekki hafa tekist að finna líkama að sýkja í viku.
Kjarninn 6. júní 2020
Jói Sigurðsson, sem sést hér fyrir miðju á myndinni og Þorgils Sigvaldason, sem stendur lengst til hægri, fengu hugmyndina að CrankWheel árið 2014.
Hafa tekist á við vaxtarverki vegna heimsfaraldursins
CrankWheel er íslenskt nýsköpunarfyrirtæki sem hefur vaxið nokkuð að undanförnu vegna áhrifa kórónuveirufaraldursins, enda gerir tæknilausn fyrirtækisins sölufólki kleift að leysa störf sín af hendi úr fjarlægð.
Kjarninn 6. júní 2020
180⁰ Reglan
180⁰ Reglan
180° Reglan – Viðtal við Christof Wehmeier
Kjarninn 6. júní 2020
Víða í Bandaríkjunum standa yfir mótmæli í kjölfar morðsins á George Floyd.
Vöxtur Antifa í Bandaríkjunum andsvar við uppgangi öfgahægrisins
Bandarískir ráðamenn saka Antifa um að bera ábyrgð á því að mótmælin sem nú einkenna bandarískt þjóðlíf hafi brotist út í óeirðir. Trump vill að hreyfingin verði stimpluð sem hryðjuverkasamtök en það gæti reynst erfitt.
Kjarninn 6. júní 2020
Hugmyndir um að hækka vatnsborð Hagavatns með því að stífla útfall þess, Farið, eru ekki nýjar af nálinni.
Ber að fjalla um hugsanlega áfangaskiptingu Hagavatnsvirkjunar
Íslenskri vatnsorku ehf. ber að sögn Orkustofnunar að fjalla um hugsanlega áfangaskiptingu fyrirhugaðrar Hagavatnsvirkjunar í frummatsskýrslu. Þá ber fyrirtækinu einnig að bera saman 9,9 MW virkjun og fyrri áform um stærri virkjanir.
Kjarninn 6. júní 2020
Telur stjórnvöld vinna gegn eigin markmiðum með hagræðingarkröfu á Hafró
Forstjóri Hafrannsóknastofnunar segir að stjórnvöld gangi gegn eigin markmiðum um eflingu haf- og umhverfisrannsókna með því að gera sífellda hagræðingarkröfu á Hafró. Hann segir stofnunina sinna hættulega litlum grunnrannsóknum.
Kjarninn 5. júní 2020
Inga Sæland
Segir sama gamla spillingarkerfið blómstra sem aldrei fyrr
„Hvenær hættir maður að verða hissa á sérhagsmunagæslunni í pólitík?“ spyr formaður Flokks fólksins.
Kjarninn 5. júní 2020
Meira úr sama flokkiFólk