CRIPSRi notað til að skoða erfðamengi baktería

Hvaða gen eru það sem bakteríur nýta sér til að verjast sýklalyfjum?

dna.jpg
Auglýsing

Þeir sem láta sig vís­indi varða hafa varla orðið var­huga af CRISPR/Cas erfða­breyt­inga­tækn­inni sem und­an­farið hefur verið „sætasta stelpan á ball­inu“ í hópnum aðferðir í sam­einda­líf­fræði.

CRISPR er upp­runnið í bakt­er­íum en með sam­ein­ingu hár­ná­kvæmr­ar þátta­pör­unn­ar og núk­le­asa­virkn­i ­kerf­is­ins ásamt DNA við­gerð­ar­ferlum spen­dýra­frumna varð til erfða­breyt­inga­tól sem er mun nákvæmara og skil­virkara en þau sem við höfum áður not­að.

Aðferðin hefur notið ákveð­innar sér­stöðu. Má þá t.d. telja að mat­væla­eft­ir­lit Banda­ríkj­anna til­kynnti á síð­asta ári að erfða­breyt­ingar sem unnar eru á mat­væl­um, þar sem CIR­SPR að­ferðin er not­uð, lúta ekki jafn ströngum reglu­gerðum og önnur erfða­breytt mat­væli.

Auglýsing

Þró­un ­með­ CRISPR að­ferð­ina hafa nú leitt hana aftur til­ ­upp­runans, í bakt­er­í­urn­ar. CRISPRi, sem stendur fyrir „clu­ster­ed reg­ulated inter­spaced pa­lindromic repeats inter­fer­ence“, er tól þar sem CRISPR er nýtt til að hindra tján­ingu á ákveðnum gen­um.

Vegna þess hve nákvæm þátta­pör­un CRISPR flókans er við mark-erfða­efn­ið, þóttu vís­inda­mönnum í Kali­forníu við hæfi að nýta aðferð­ina til að hindra tján­ingu gena. Hindr­unin fer ein­fald­lega þannig fram að CRISPR flók­inn situr á erfða­efn­inu svo pró­tínin sem sjá um tján­ingu gen­anna (um­rit­un­ar­þætt­irn­ir) kom­ast ekki að.

Þessi nýja aðferð hentar t.d. mjög vel þegar ein­tökin tvö af gen­inu sem eru til staðar í tví­litna frumu (eitt frá móður og eitt frá föð­ur) eru mis­mun­andi. Þá er hægt að nýta CRISPRi til að þagga tján­ing­una á öðru gen­inu og sjá hvaða áhrif það hef­ur.

Rann­sókn­ar­hópur við Uni­versity of Wiscons­in-Ma­d­i­son nýtti aðferð­ina nýlega til að skoða hvaða gen það eru sem bakt­er­íur nýta sér til að verj­ast sýkla­lyfj­um. Hóp­ur­inn byggði sér gena­safn sem hann gat svo prófað á fjöl­mörgum bakt­er­íu­stofn­um, bæði bakt­er­íum sem valda sýk­ingum og þeim sem gera það ekki.

Hóp­ur­inn gerir sér vonir um að geta nýtt þá þekk­ingu sem skap­ast í slíkum til­raunum til að þróa betri sýkla­lyf þegar við skiljum betur hvaða þætti bakt­er­í­urnar nýta sér þegar með­höndlun með sýkla­lyfjum á sér stað.

Fréttin birt­ist fyrst á Hvat­inn.is

Sigurður Ingi Friðleifsson
Lækkun, lækkun, lækkun
Kjarninn 19. ágúst 2019
Fermetrinn á tæpar 840 þúsund krónur
Miklar framkvæmdir hafa verið í miðbænum undanfarin ár og nú eru íbúðir komnar á sölu við Hverfisgötu 85-93. Ein tveggja herbergja íbúðin í húsinu er sett á 38,9 milljónir króna.
Kjarninn 19. ágúst 2019
Telja þrengt að atvinnu- og menntamöguleikum fólks með ADHD
Að mati ADHD samtakanna byggja breyttar reglur Mennta- og starfsþróunarseturs lögreglunnar á vanþekkingu og úreltum hugmyndum en nú segir í læknisfræðilegum viðmiðum þeirra að greiningin ADHD/ADD geti verið útilokandi þáttur.
Kjarninn 19. ágúst 2019
Gildi selur hlut sinn í HB Granda/Brim vegna kaupa á sölufélögum
Einn stærsti lífeyrissjóður landsins hefur selt Kaupfélagi Skagfirðinga nær allan hlut sinn í HB Granda, sem nú heitir Brim, vegna viðskipta sem félagið hefur átt við stærsta hluthafa sinn.
Kjarninn 19. ágúst 2019
Samfylkingin bætir verulega við sig og mælist næst stærsti flokkurinn
Sjálfstæðisflokkurinn mælist með 19 prósent fylgi aðra könnunina í röð. Píratar og Flokkur fólksins tapa fylgi milli mánaða en Samfylkingin bætir verulega.
Kjarninn 19. ágúst 2019
Eiríkur Ragnarsson
Nokkrar staðreyndir um Reykjavíkurmaraþonið
Kjarninn 19. ágúst 2019
Kristbjörn Árnason
Sóun
Leslistinn 19. ágúst 2019
Sigursteinn Másson
Hver á að gera hvað?
Kjarninn 19. ágúst 2019
Meira úr sama flokkiFólk