CRIPSRi notað til að skoða erfðamengi baktería

Hvaða gen eru það sem bakteríur nýta sér til að verjast sýklalyfjum?

dna.jpg
Auglýsing

Þeir sem láta sig vís­indi varða hafa varla orðið var­huga af CRISPR/Cas erfða­breyt­inga­tækn­inni sem und­an­farið hefur verið „sætasta stelpan á ball­inu“ í hópnum aðferðir í sam­einda­líf­fræði.

CRISPR er upp­runnið í bakt­er­íum en með sam­ein­ingu hár­ná­kvæmr­ar þátta­pör­unn­ar og núk­le­asa­virkn­i ­kerf­is­ins ásamt DNA við­gerð­ar­ferlum spen­dýra­frumna varð til erfða­breyt­inga­tól sem er mun nákvæmara og skil­virkara en þau sem við höfum áður not­að.

Aðferðin hefur notið ákveð­innar sér­stöðu. Má þá t.d. telja að mat­væla­eft­ir­lit Banda­ríkj­anna til­kynnti á síð­asta ári að erfða­breyt­ingar sem unnar eru á mat­væl­um, þar sem CIR­SPR að­ferðin er not­uð, lúta ekki jafn ströngum reglu­gerðum og önnur erfða­breytt mat­væli.

Auglýsing

Þró­un ­með­ CRISPR að­ferð­ina hafa nú leitt hana aftur til­ ­upp­runans, í bakt­er­í­urn­ar. CRISPRi, sem stendur fyrir „clu­ster­ed reg­ulated inter­spaced pa­lindromic repeats inter­fer­ence“, er tól þar sem CRISPR er nýtt til að hindra tján­ingu á ákveðnum gen­um.

Vegna þess hve nákvæm þátta­pör­un CRISPR flókans er við mark-erfða­efn­ið, þóttu vís­inda­mönnum í Kali­forníu við hæfi að nýta aðferð­ina til að hindra tján­ingu gena. Hindr­unin fer ein­fald­lega þannig fram að CRISPR flók­inn situr á erfða­efn­inu svo pró­tínin sem sjá um tján­ingu gen­anna (um­rit­un­ar­þætt­irn­ir) kom­ast ekki að.

Þessi nýja aðferð hentar t.d. mjög vel þegar ein­tökin tvö af gen­inu sem eru til staðar í tví­litna frumu (eitt frá móður og eitt frá föð­ur) eru mis­mun­andi. Þá er hægt að nýta CRISPRi til að þagga tján­ing­una á öðru gen­inu og sjá hvaða áhrif það hef­ur.

Rann­sókn­ar­hópur við Uni­versity of Wiscons­in-Ma­d­i­son nýtti aðferð­ina nýlega til að skoða hvaða gen það eru sem bakt­er­íur nýta sér til að verj­ast sýkla­lyfj­um. Hóp­ur­inn byggði sér gena­safn sem hann gat svo prófað á fjöl­mörgum bakt­er­íu­stofn­um, bæði bakt­er­íum sem valda sýk­ingum og þeim sem gera það ekki.

Hóp­ur­inn gerir sér vonir um að geta nýtt þá þekk­ingu sem skap­ast í slíkum til­raunum til að þróa betri sýkla­lyf þegar við skiljum betur hvaða þætti bakt­er­í­urnar nýta sér þegar með­höndlun með sýkla­lyfjum á sér stað.

Fréttin birt­ist fyrst á Hvat­inn.is

Við þurfum á þínu framlagi að halda

Þú getur tekið beinan þátt í að halda úti öflugum fjölmiðli.

Við sem vinnum á ritstjórn Kjarnans viljum hvetja þig til að vera með okkur í liði og leggja okkar góða fjölmiðli til mánaðarlegt framlag svo við getum haldið áfram að vinna fyrir lesendur, fyrir fólkið í landinu.

Kjarninn varð níu ára í sumar. Þegar hann hóf að taka við frjálsum framlögum þá varð slagorðið „Frjáls fjölmiðill fyrir andvirði kaffibolla“ til og lesendur voru hvattir til að leggja fram í það minnsta upphæð eins kaffibolla á mánuði.

Mikið vatn hefur runnið til sjávar á þeim níu árum sem Kjarninn hefur lifað. Í huga okkar á Kjarnanum hefur þörfin fyrir fjölmiðla sem veita raunverulegt aðhald og taka hlutverk sitt alvarlega aukist til muna.

Við trúum því að Kjarninn skipti máli fyrir samfélagið.

Við trúum því að sjálfstæð og vönduð blaðamennska skipti máli.

Ef þú trúir því sama þá endilega hugsaðu hvort Kjarninn er ekki allavega nokkurra kaffibolla virði á mánuði.

Vertu með okkur í liði. Þitt framlag skiptir máli.

Ritstjórn Kjarnans: Sunna Ósk Logadóttir, Þórður Snær Júlíusson, Erla María Markúsdóttir, Arnar Þór Ingólfsson, Eyrún Magnúsdóttir og Grétar Þór Sigurðsson.


Já takk, ég vil styrkja Kjarnann!
Þorbjörn Guðmundsson
Er íslenska velferðarkerfið ekki lengur griðarstaður þeirra sem minnst hafa?
Kjarninn 11. janúar 2023
Takk fyrir og sjáumst á nýjum miðli á föstudag
Bréf frá ritstjóra Kjarnans vegna sameiningar við Stundina og þess að nýr framsækinn fréttamiðill verður til í lok viku.
Kjarninn 11. janúar 2023
Sverrir Albertsson
Vatn á myllu kölska
Kjarninn 11. janúar 2023
Lögreglumenn standa vörð um gröfurnar í námunni.
Berjast fyrir þorpi á barmi hengiflugs
Lítið þorp í Rínarlöndum Þýskalands er allt komið í eigu kolarisa. Fyrirtækið ætlar sér að mylja niður húsin og stækka kolanámu sína sem þegar þekur um 80 ferkílómetra. Þetta þykir mörgum skjóta skökku við í heimi sem berst við loftslagsbreytingar.
Kjarninn 10. janúar 2023
Arnþrúður Karlsdóttir, útvarpsstjóri Útvarps Sögu.
Útvarp Saga telur fjölmiðlastyrki skapa tortryggni og bjóða upp á frændhygli
Fjögur fjölmiðlafyrirtæki hafa til þessa skilað inn umsögnum um frumvarp Lilju Alfreðsdóttur menningar- og viðskiptaráðherra, sem mun að óbreyttu framlengja núverandi styrkjakerfi til fjölmiðla.
Kjarninn 10. janúar 2023
Sólveig Anna Jónsdóttir formaður Eflingar.
Viðræðum slitið og Efling undirbýr verkfallsaðgerðir
Samtök atvinnulífsins hafa hafnað gagntilboði Eflingar um skammtímakjarasamning, sem kvað á um meiri launahækkanir en SA hefur samið um við aðra hópa á almennum vinnumarkaði til þessa. Efling undirbýr nú verkfallsaðgerðir.
Kjarninn 10. janúar 2023
Palestínski fáninn á lofti í mótmælum í Reykjavík. Ísraelskri lögreglu hefur nú verið fyrirskipað að rífa fánann niður á almannafæri.
Fánabann og refsiaðgerðir í Palestínu í kjölfar niðurstöðu Sameinuðu þjóðanna
Degi eftir að ný ríkisstjórn tók við völdum í Ísrael samþykkti allsherjarþing Sþ að fela Alþjóðadómstólnum í Haag að meta lögmæti hernáms Ísraelsríkis á Vesturbakkanum. Síðan þá hefur stjórnin gripið til refsiaðgerða og nú síðast fánabanns.
Kjarninn 10. janúar 2023
Gríðarlega mikil dæling á sandi á sér stað í Landeyjahöfn á hverju ári. Markarfljótið ber hundruð þúsunda tonna af jarðefnum út í sjó og það á til að safnast upp í mynni hafnarinnar.
Vilja sjúga sand af hafsbotni í stórum stíl og flytja út
Eftirspurn eftir íslenskum jarðefnum er gríðarleg ef marka má framkomin áform erlendra stórfyrirtækja um nýtingu þeirra. Vinsældir hafnarinnar í Þorlákshöfn eru samhliða mjög miklar.
Kjarninn 10. janúar 2023
Meira úr sama flokkiFólk